大正の移築から７０年余を経ており、基壇および礎石に歪みがみられ、一部に蟻害、虫害も発生したうえ、屋根も特に向拝を中心に傷みが進行していました。今回の本殿修理に伴う調査により、文化１０年当時の屋根は栗の柿葺であったことが判明しましたが、透塀・拝殿など他の社殿が檜皮葺であることから、境内全体の調和を図るため復元はせず、現状の檜皮葺のままの半解体工事となりました。解体範囲は向拝の大半、縁廻り、造作の一部などで、傾いている建物の屋起しを行い、旧状どおりに組み立てられました。屋根については、耐久年限に達していた檜皮葺を平葺・軒葺とも全面葺き直し、雨水が浸入して腐朽がみられた箱板・鬼板・千木・勝男木は銅板により包み直しました。